疫病是辣椒的一种毁灭性病害，苗期和成株期均可发病。幼苗茎基部呈水浸状暗褐色缢缩，造成幼苗折倒和湿腐，而后枯萎死亡。成株发病时，病叶上有淡绿色近圆形斑点，扩大后边缘呈黄绿色，中间暗褐色，湿度大时可见白霉，叶片软腐脱落。茎部发病多在茎基部和枝杈处，初产生水浸状暗绿色病斑，后扩展成不规则形黑褐色斑，绕茎一圈后病斑处的皮层腐烂，缢缩，使植株折倒。病果的果蒂部有水浸状暗绿斑，潮湿时长有白色霉状物，病部呈褐色，腐烂脱落，干燥后成为褐色僵果。根系被侵染后变褐色，皮层腐烂导致植株青枯死亡。
辣椒根腐病多发生于定植后。发病初期、病株枝叶特别是顶部叶片稍见萎蔫，傍晚至次日早晨恢复，症状反复数日后。叶片全部萎蔫、但叶片仍呈绿色；病株的茎部及根部皮层呈淡褐色及深褐色腐烂，极易剥离，露出木质部；横切茎观察，可见维管束变褐色，后期潮湿时可见病部长出白色至粉红色霉层（病菌分生孢子）。
属土传病害，主要发生在结果期，对产量影响较大。植株下部叶片大量脱落，茎基部呈水浸状腐烂，地上部茎叶迅速凋萎，后期全株枯死；根系水浸状软腐，木质部变成暗褐色，湿度大时常产生白色或蓝绿色的霉状物。气温24~28℃，潮湿或水渍田易发病，雨后积水发病更重；主要通过灌溉水传播。
辣椒生产中的毁灭性病害，发病初期中午叶片萎蔫，傍晚以后恢复正常，后整株凋萎不再恢复而死亡，露地多发生在雨后，成片或整块田萎焉死亡。植株死亡后仍保持青色，病茎外表症状不明显，茎内部维管束变褐色，横切面湿润后可见乳白色粘液溢出，有臭味。本病由细菌引起。地温20~25℃，气温30~35℃；连阴雨后骤晴，缺钾肥，连作重茬地和低洼地块均利于发病。
辣椒死棵怎样防治
辣椒死棵是一类病害，要根据这几种病害的特点采取相应的防治方法：这几种病害都能借水传播，病源菌多在土中，能在土中侵染辣椒根系，而像疫病、青枯病，还可以直接侵染辣椒的茎叶等地上部器官，根腐病、疫病可以在苗期侵染辣椒，也可以在成株期侵染辣椒，可以说是在辣椒的整个生育期都可侵染。
1、进行土壤清理及消毒
前茬蔬菜收获后，及早清洁田园，耕翻土地，闷棚20~30天，棚内温度达50℃以上，可有效杀死土壤中的各种病菌。
2、种子消毒
清水浸种4~6小时，再用200倍多菌灵水溶液浸泡30分钟，然后捞出种子，用清水冲洗干净，待播。
3、苗床土处理
50%乙磷铝锰锌+30%DT每平米10克加细干土20斤拌匀撒于床面，然后整平床面播种。
4、定植时防治
辣椒定植采取大小行种植，按照每栽1000棵苗子各用药1.5斤计算，用50%乙磷铝锰锌+30%DT+细干土30斤充分拌匀撒入穴内，然后定植。
5、定值管理
浇水时冲施生物菌肥或壳聚糖肥料，促进土壤有益菌繁殖。
枯草芽孢杆菌-绿陇生物
枯草芽孢杆菌能产生多种抗菌素和酶，具有广谱抗菌活性和极强的抗逆能力。通过竞争、杀菌、促生等多种作用方式综合发挥达到防病、固氮、解磷解钾的功效，同时对作物的根腐、立枯、枯萎、烂根、死棵等效果显著，对因重茬引起的各种土传病害有很强的防治作用。